Těžební průmysl zůstává díky byrokracii a průtahům s udělováním potřebných licencí nevýznamný. Na území Beninu jsou podle odhadu zásoby kvalitní železné rudy v objemu 250 milionů tun, dále zlata, značné jsou zásoby fosfátů. V provincii Ouémé byly objeveny zásoby vápence pro výrobu cementu a stavebního vápna. Nová cementárna Nocibé zahájila výrobu v roce 2013, roční produkce má být 1,5 mil. tun. Cement se do Beninu i tak dováží ve značných objemech. V Beninu se těžila v malém množství i ropa - v šelfovém pásmu moře u Sémé v blízkosti hranic s Nigérií, nigerijská firma South Atlantic Petroleum plánuje těžbu u Sémé v roce 2014 obnovit..
